決死の覚悟でディオの館に突入したポルナレフ、アヴドゥル、イギー。そこには暗黒空間を作り出すヴァニラ・アイスが潜んでいた！最初にアヴドゥルが暗黒に飲み込まれ、消滅してしまったが…！？

仗助は破壊したものを修復するスタンドを持っていた。そして町のどこかに弓と矢を使って悪のスタンド使いを増やしている者がいるのだ！　仗助は荒れた屋敷に住む虹村兄弟と対決する…！

朝の街角で仗助たちと吉良の市街戦が始まった。家の中に逃げ込んだ仗助たちに吉良の放つ「空気爆弾」が迫る！　何故か正確に位置をつかんで発射される、爆弾の脅威にさらされる仗助たちは…！？

吉良はエステティシャンの力で別人に顔を変え町の中に消えた…。亡霊となった吉良の父親が持つ「弓と矢」の力でスタンド使いとなった少年がジャンケン勝負を露伴に挑んできた。勝負の行方は…？

ディオのスタンド、「世界」は時を止める恐るべき能力だった。花京院に続き、ジョジョも「世界」の犠牲になろうとしていた。その時ジョジョの指が動いた。長い戦いに終止符が打たれるのか…！？

砂漠を越え、エジプトを行くジョジョ一行にちょっと間抜けなオインゴ・ボインゴ兄弟が迫るが、あえなく敗退…。だが今度は持った者を操る妖刀のスタンド、「アヌビス神」がポルナレフを襲う…。

ジョジョ一行はシンガポールに到着。ホテルの客室でポルナレフは無気味な人形に襲われる！　人形を倒したのも束の間、今度は、いつも冷静な花京院の様子が変だ。またしても敵スタンドの急襲か？

作品のためなら手段を選ばない漫画家、岸辺露伴を倒した仗助。だが本当に凶悪なスタンド使いは露伴ではなかった。スタンド能力を持ったネズミを狩るため、承太郎と仗助は怪しい農家に向かう…！

エジプトに向け、インドを横断中のジョジョ一行だったが、アヴドゥルが敵スタンド、ホル・ホースの凶弾に倒れた！　ポルナレフは共謀者、Ｊ・ガイルを倒す。だが今度はジョセフの腕に異変が…！

ジョジョ一行は香港で出会ったスタンド使いポルナレフを仲間に迎え入れた。ジョジョたちは、おかしな密航少女とともにシンガポールまでの船旅を始めるが次々とディオの放つ敵スタンドが迫る…！